1、提交的资料不一样。企业商标注册，需要企业执照复印件，而个人商标注册除了本人个体工商执照复印件外，还需要本人身份证复印件。

2、注册商标后商标所有权不同，公司注册是归公司所有，个人注册是归个人。当公司倒闭后，如果商标不做处理，申请主体营业执照无效了，商标也就无效了，个人名义不会存在这个问题。

3、对于商标信息变动后需要做的一些措施也不同。例如办公地址变了，公司名称变了，这些在商标上都要有相应的变更;个人商标是注册在身份证上的，而户籍一般情况下很难变化。所以相对来说比较稳定。

4、个人注册的时候商标注册的商品服务类别必须与营业执照上的经营范围相关;公司注册的商品服务类别不受限定。这也是为了防范打着个体工商户的旗号把抢注商标当做主业的高级商标“黄牛”。

5、在商标在申请的时候对于商标登记的申请人名义也有不同的要求。个体户申请可以以其《个体工商户营业执照》登记的字号作为申请人名义提出商标注册申请，也可以以执照上登记的负责人名义提出商标注册申请;也可以以全体合伙人的名义共同提出商标注册申请。